Técnica de hibridación para la leucemia mieloide crónica

  Leucemia mieloide crónica

La leucemia mieloide crónica (LMC) es una de las neoplasias humanas mejor caracterizadas, típicamente asociada a la translocación entre los cromosomas 9 y 22 que da lugar al gen de fusión BCR::ABL1, detectable en la mayoría de los casos mediante hibridación in situ fluorescente (FISH) y cariotipo.

Imagen obtenida de:https://fcarreras.org/blog/paradigmalmc/

Pasos de la Hibridación In Situ Fluorescente (FISH) en el diagnóstico de LMC:

1. Recolección de muestra: Se obtiene una muestra de médula ósea o sangre periférica del paciente con sospecha de LMC.
2. Preparación celular: Se realiza un cultivo celular y tratamiento para obtener células en metafase. Las células se fijan y se colocan sobre un portaobjetos.
3. Desnaturalización del ADN: El ADN cromosómico se desnaturaliza mediante tratamiento térmico o químico, para permitir el acceso de las sondas.
4. Hibridación de la sonda: Se añaden sondas fluorescentes específicas para los genes BCR (cromosoma 22) y ABL1 (cromosoma 9). Estas sondas están marcadas con fluorocromos diferentes (por ejemplo, verde para BCR y rojo para ABL1). Si existe una fusión BCR::ABL1, las señales se superponen y forman una señal amarilla (fusión).
5. Lavado post-hibridación: Se eliminan las sondas no unidas mediante lavados específicos.
6. Contratinción: Se tiñe el núcleo con DAPI u otro colorante fluorescente para facilitar la visualización del núcleo celular.
7. Visualización: Se examina la muestra bajo un microscopio de fluorescencia. Se analizan al menos 200 núcleos/interfases o metafases buscando patrones de señal: señales separadas indican normalidad; señales fusionadas indican translocación.
8. Interpretación de resultados: En este caso particular, FISH fue negativo a pesar de la presencia de la fusión BCR::ABL1, debido a una inserción extremadamente pequeña (122 kb) que no fue detectada por las sondas comerciales estándar.

Video obtenido de: https://www.youtube.com/watch?v=ZKr53uObMIQ

Referencias bibliográficas:

1. May PC, Reid AG, Robinson ME, Khorashad JS, Milojkovic D, Claudiani S, et al. FISH-negative BCR::ABL1-positive e19a2 chronic myeloid leukaemia: the most cryptic of insertions. BMC Medical Genomics [Internet]. 26 de julio de 2023[citado el 15 de junio de 2025];16(1). Disponible en: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10369825/

Prueba RT‑PCR para SARS‑CoV‑2

 SARS-CoV-2

Virus que causa una enfermedad respiratoria llamada enfermedad por coronavirus de 2019 (COVID-19). El SARS-CoV-2 es un virus de la gran familia de los coronavirus. Los coronavirus infectan a seres humanos y algunos animales. 

Imagen obtenida de:https://www.un.org/es/coronavirus

Tipo de muestras biológicas:

• Hisopado nasofaríngeo o orofaríngeo en pacientes ambulatorios.
• En casos graves: esputo, aspirado endotraqueal o lavado broncoalveolar.

Extracción del ácido nucleico:

• Las muestras deben procesarse para aislar ARN viral, utilizando métodos consolidados como extracción por columnas de sílice o perlas magnéticas, bien sea de forma manual o automatizada.

Tipo de PCR:

• Se emplea RT‑PCR en tiempo real (real‑time RT‑PCR), que incluye un paso de transcripción inversa para convertir el ARN viral en ADN complementario previo a su amplificación.

Genes amplificados:

El protocolo recomienda amplificar, al menos, uno o varios genes virales altamente conservados, típicamente:

• Gen E (envoltura)

• Gen RdRP (ARN polimerasa dependiente de ARN)

• Gen N (nucleocápside)

Tipo de resultados:

• El resultado se presenta cualitativo: se confirma si la muestra es positiva o negativa para SARS‑CoV‑2.

Referencias bibliográficas:

1. Communicable Diseases. Laboratory testing for 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) in suspected human cases [Internet]. 2020[citado el 08 de junio de 2025]. Disponible en: https://www.who.int/publications/i/item/10665-331501

Técnica de secuenciación para la enfermedad de Huntington

 Enfermedad de Huntington

La enfermedad de Huntington es un trastorno progresivo con alteraciones motoras, cognitivas y psiquiátricas. La edad media de aparición es de 35 a 44 años, y la mediana de supervivencia es de 15 a 18 años.

Imagen obtenida de:https:https://www.infobae.com/peru/2024/08/30/la-enfermedad-de-huntington-un-trastorno-que-afecta-el-cerebro-y-puede-impedirte-caminar-hablar-o-comer/

La enfermedad de Huntington es una patología neurodegenerativa progresiva causada por la expansión anómala de repeticiones CAG en el gen HTT, lo que se detecta exclusivamente mediante análisis genético dirigido. Las técnicas de secuenciación convencionales como paneles multigénicos, exoma o genoma completo no identifican estas expansiones; por ello, se requiere el uso de métodos específicos como PCR convencional, PCR con cebadores de tripletes (TP-PCR) y Southern blot para determinar con precisión el número de repeticiones. 

Video obtenido de: https://www.youtube.com/watch?v=_Sf9OTCG8n0

Referencias bibliográficas:

1. Caron NS, Wright GE, Hayden MR. Huntington Disease [Internet]. GeneReviews® - NCBI Bookshelf. 2020 [citado el 01 de junio de 2025]. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1305/

Alteraciones de la epigenética del cáncer gástrico

 Cáncer gástrico

El cáncer gástrico es una de las principales causas de muerte por cáncer a nivel mundial, asociado principalmente con la infección por Helicobacter pylori. 

Imagen obtenida de: https://www.mayoclinic.org/es/diseases-conditions/stomach-cancer/symptoms-causes/syc-20352438

El cáncer gástrico se caracteriza no solo por alteraciones genéticas, sino también por modificaciones epigenéticas significativas que juegan un papel clave en su desarrollo y progresión. Entre estas alteraciones epigenéticas destacan la hipermetilación de genes supresores de tumores (como CDH1, MLH1, y CDKN2A), la hipometilación de protooncogenes (como HRAS y c-MYC), y cambios en la expresión de enzimas epigenéticas como las ADN metiltransferasas (DNMTs) y desacetilasas de histonas (HDACs). 

Video obtenido de: https://www.youtube.com/watch?v=0Z0_fnymE9U

Referencias bibliográficas:

1. Canale M, Casadei-Gardini A, Ulivi P, Arechederra M, Berasain C, Lollini PL, et al. Epigenetic Mechanisms in Gastric Cancer: Potential New Therapeutic Opportunities. International Journal Of Molecular Sciences [Internet]. 31 de julio de 2020[citado el 24 de mayo del 2025];21(15):5500. Disponible en: https://doi.org/10.3390/ijms21155500

   

   
   

   
   

   
    

Alteraciones de la traducción en el Alzheimer

 Alzheimer

La enfermedad de Alzheimer es el tipo más común de demencia relacionada con la edad, para la cual aún no existe cura. Actualmente, se estima que entre el 10 % y el 30 % de la población mayor de 65 años padece la enfermedad de Alzheimer.

Imagen obtenida de: https://gna.org.co/que-es-el-alzheimer/

La enfermedad de Alzheimer, además de caracterizarse por la acumulación de placas de β-amiloide y ovillos neurofibrilares de Tau, también presenta profundas alteraciones en la regulación del ARN, especialmente en el proceso de traducción. Diversos genes vinculados al riesgo de desarrollar alzheimer, como APP, PSEN1, MAPT (Tau), BACE1, y SORL1, muestran cambios en sus isoformas de mRNA y en sus niveles de expresión debido a modificaciones en el splicing, poliadenilación y estabilidad del ARN. Estos cambios no solo afectan qué proteínas se expresan, sino también cómo se traducen en el entorno neuronal.

Video obtenido de: https://youtu.be/OQUfsnkmsL8?si=KTHh7dSQ9yVgyrww

Referencias bibliográficas:

1. Rybak-Wolf A, Plass M. RNA Dynamics in Alzheimer’s Disease. Molecules [Internet]. 24 de agosto de 2021[citado el 18 de mayo de 2025];26(17):5113. Disponible en: https://www.mdpi.com/1420-3049/26/17/5113

Alteraciones de la transcripción en la ictericia neonatal

 Ictericia neonatal

La ictericia neonatal es una condición común en recién nacidos, caracterizada por la coloración amarillenta de la piel y los ojos debido a un aumento de bilirrubina en sangre. 

Imagen obtenida de: https://www.gestacaobebe.com.br/ictericia-neonatal/

El estudio publicado en Nature Communications explora las bases genéticas de la ictericia neonatal mediante un análisis de asociación del genoma completo (GWAS) en una amplia muestra de recién nacidos. Los hallazgos principales indican una asociación significativa con variantes genéticas en el gen UGT1A1, que codifica una enzima clave en el metabolismo de la bilirrubina. Se encontró que una variante heredada materna en la región promotora de este gen puede afectar la expresión del mismo en el hígado fetal, aumentando el riesgo de ictericia.

Video obtenido de: https://www.youtube.com/watch?v=jvb5GkLWxM0

Referencias bibliográficas:

1. Solé-Navais P, Juodakis J, Ytterberg K, Wu X, Bradfield JP, Vaudel M, et al. Genome-wide analyses of neonatal jaundice reveal a marked departure from adult bilirubin metabolism. Nature Communications [Internet]. 30 de agosto de 2024[citado el 11 de mayo de 2025];15(1). Disponible en: https://www.nature.com/articles/s41467-024-51947-w#citeas

Alteraciones de la genómica en apendicitis aguda

La apendicitis aguda

La apendicitis aguda es una inflamación del apéndice, una pequeña estructura que se encuentra en el ciego del colon. Aunque se sabe que es una afección común, no se entiende completamente por qué algunas personas desarrollan apendicitis aguda y otras no.

Imagen obtenida de: https://cegagdl.com/apendicitis-aguda/

Un estudio genómico internacional con más de 2,2 millones de personas identificó variantes genéticas asociadas a la apendicitis aguda , especialmente en genes relacionados con la respuesta inmune. Entre los SNPs destacados, el HLA-C rs2524046 se asoció tanto con apendicitis aguda como con la enfermedad celíaca, lo que sugiere que el gluten podría estar implicado en procesos inflamatorios similares en ambas afecciones. Utilizando análisis GWAS y la plataforma CTG-VL, se hallaron nueve genes vinculados a la susceptibilidad a apendicitis aguda. Estos hallazgos abren nuevas líneas de investigación sobre cómo la genética y la dieta interactúan en enfermedades inflamatorias del aparato digestivo.

Video obtenido de: https://www.youtube.com/watch?v=aMttoUUoKAk

Referencias bibliográficas:

1. Ryoo M, Hwang L d., Wright O, Brown J, De Pouplana LR, Roura E. Several genetic SNPs identified in acute appendicitis patients including the HLA-C known to be related to coeliac disease in a Genome-Wide Association Study. Proceedings Of The Nutrition Society [Internet]. 1 de abril de 2024[citado el 04 de mayo de 2025];83(OCE1). Disponible en: https://www.cambridge.org/core/journals/proceedings-of-the-nutrition-society/article/several-genetic-snps-identified-in-acute-appendicitis-patients-including-the-hlac-known-to-be-related-to-coeliac-disease-in-a-genomewide-association-study/61D8AC55F4185ED800202CB502DBD6D9#

Foto de como hice mi búsqueda: